研究室について
これまでの軌跡と現在個人か？ チームか？
研究、特に理論・情報系の研究は、アイディアを深化させる個人が完全な主体です。 研究室は、個々人の理論や結果をアクティブに議論し、また研究活動をサポートする環境を提供します。 結果として共同研究も発生しますが、チームプレーをアプリオリに想定していません。
あるとすれば個々のスタンドプレーから生じる、チームワークだけだ (荒巻大輔)。
メンバー
理論からデータ解析までカバーしています。
現在、物理、工学、数理、生命情報など幅広い分野の研究員・大学院生が在籍しています。
小林 徹也
教授
定量生物学、応用数学
上村 淳
特任助教
生物物理。生命の起源
Simon Schnyder
特任助教
アクティブマター、集団動態
島田 真成
特任助教
統計物理、化学反応論
Dimitri Loutchko
特任研究員
物理化学。反応熱力学
Ignacio Madrid
特任研究員
分枝過程。進化動態
Praful Gagrani
特任研究員
化学反応理論と応用
中島 蒼
協力研究員
応用数学、個体群動態
堅山 耀太郎
協力研究員
免疫レパトアの深層学習モデル
鳥取 岳広
協力研究員
制御理論
堀口 修平
協力研究員
免疫系の学習と適応
香取 真知子
博士課程学生
増殖系の定量生物学(仮)
木下 恭兵
博士課程学生
免疫系
加藤 雅己
博士課程学生
細胞集団の情報処理
Zi Hui (Violet)
修士課程学生
嗅覚系とにおい認知の機械学習
今泉 謙斗
修士課程学生
嗅覚情報処理
杉江 恵輔
修士課程学生
化学反応ネットワーク
何 腾蛟
修士課程学生
細胞集団シミュレーション
安武 達益
修士指導委託
メタゲノムの深層学習
上村 瞭介
修士課程学生
未定
青木 美帆
テクニカルスタッフ
イラストレーション
卒業生
幸い今のところは、研究員・学生ともに良い形で卒業できています。
Paul François
国際協力研究員 (2024/01~2024/06)
理論定量生物学
谷本 佑馬
修士課程学生 (2022/04~2024/03)
隠れ状態推定の数理と応用
杉山 友規
特任助教 (2014/04~2023/11)
大偏差理論、熱力学
Chengkai Yang
修士 (2021/10~2023/9)
scRNAseq 発生動態推定
山口 尚人
修士 (2019/4~2023/8)
バイオインフォマティクス
中村 絢斗
修士・博士 (2018/4~2023/3)
生体の環境感知と制御
张 梦吉
訪問博士学生 (2022/6~2023/1)
匂い認知の深層学習
宮原 英之
闖入者 (201?/4~2021/3)
量子機械学習
高倉 勇気
特任研究員 (2020/4~2021/3)
免疫学、胸腺発生
斎藤 陽平
研究員 (2014/4~2021/3)
場の理論, 意識の理論
飯田 渓太
特任助教 (2018/7~2019/3)
確率遺伝子発現, 数理物理学
江島 啓介
学振 研究員 (2015/4~2018/3)
感染症・肥満の伝播モデル
横田 亮
博士・特任研究員(2009/4~2018/3)
神経科学、免疫レパートリ
梶田 真司
博士・特任研究員(2012/4~2017/9)
分子認識・判別機構の数理理論
上村 淳
特任研究員(2010/4~2012/3)
最適性から捉える生体情報処理の理論
Khayrul Bashar
特任助教 (2010/4~2014/3)
Bioimageinformatics、医療画像解析
金子 和正
修士・博士(2015/4~2020/3)
免疫細胞群の力学系モデル
松井 崇晃
修士学生(2017/4~2019/3)
胚発生の力学モデル
錦野 敬三郎
修士学生(2017/4~2019/3)
非線形データ解析. 細胞集団運動
澁江 一樹
修士学生(2016/4~2018/9)
バイオイメージインフォマティクス
加藤 卓也
修士学生(2016/4~2018/3)
獲得免疫系の学習理論
三木 翔太
修士学生(2014/4~2016/3)
相互作用による増殖系の比率制御
神永 祐貴
修士学生(2013/4~2015/3)
免疫多様性の統計推定モデル
我満 拓弥
修士学生(2013/4~2015/3)
エピジェネティク記憶の確率遷移モデル
今泉 宏之
修士学生(2012/4~2013/3)
免疫多様性形成の数理モデル
山田 智之
修士学生(2010/4~2011/3)
細胞の運命決定における 細胞内ダイナミクス
金澤 貴弘
生命動態実習生 (2022/10~2023/02)
化学反応力学系の幾何学
安部 哲
生命動態実習生 (2021/10~2022/02)
免疫の学習モデル
高田 幹也
生命動態実習生 (2021/04~2021/08)
細胞複製の統計法則
千葉 元太
生命動態実習生 (2020/10~2021/02)
自己複製反応モデル
別府 正太郎
生命動態実習生 (2020/10~2021/02)
自己複製反応モデル
諏訪園 佳綾
生命動態実習生 (2020/10~2021/02)
嗅覚系の混合分子認識
廣兼 空
UROP実習生 (2019/04~2020/08)
自己複製系の成長・増殖則
宋 裕進
生命動態実習生 (2019/04~2019/09)
完全適応と反応構造
Mohamed BOUBAKOUR
研究実習生 (2018/10~2019/03)
統計物理学
Elysia Chou
Amgen 研修生 (2018/06~08)
Thermodynamics of adaptation
中林 亮
生命動態実習生 (2015/10~2017/03)
細胞集団運動のデータ解析
横川 翔子
UROP実習生 (2014/10~2015/03)
着床前胚の画像・系譜解析
Phalgun C. Chintala
IAESTE 交換留学生(2012/08~11)
Bioimage informatics
Alexander Schmidt
IAESTE 交換留学生 (2011/11~2012/1)
理論生物学
David Dylus
交換留学生 (2008/10~2009/10)
極性形成の数理モデル
Gisler Fabienne
IAESTE 交換留学生(2009/07~08)
Bioimage informatics
研究室の軌跡
